Кафедра «Информационные технологии» (ИТ) была основана в 2000 году в составе шести преподавателей и готовила выпускников по специальности 35.14.00 «Прикладная информатика в экономике».
Первой заведующей кафедрой ИТ была Васина Галина Ивановна, доцент, кандидат технических наук. Свою преподавательскую и научную деятельность она начала в 1967 году в институте цветных металлов и золота г. Красноярска и до настоящего времени работает в должности профессора на кафедре «Экономика и информационные технологии менеджмента» (ЭИТМ), ведет активную научную работу и является опытнейшим преподавателем кафедры.
В 2004-2005 г. г. должность заведующего кафедрой возглавляла Джиоева Наталья Николаевна, кандидат технических наук, доцент. В настоящее время преподаватель кафедры ЭИТМ.
В 2005-2008 г. г. заведующим кафедрой ИТ являлся Ковалев Игорь Владимирович, доктор технических наук, профессор. В 2006 году под его руководством была открыта программа подготовки магистров 080500.68.03 «Информационный менеджмент», по направлению 080500.68 «Менеджмент». В настоящее время он является заведующим кафедрой «Системный анализ» в СибГАУ.
С 2008 года заведующей кафедрой стала Ступина Алена Александровна, доктор технических наук, профессор. Под ее руководством было открыто направление 080800.62 «Прикладная информатика», бакалавриат.
За период с 2000 по 2010 гг. на кафедре создавалась учебно-методическая база для проведения занятий со студентами технических и экономических специальностей, а также магистров. Повышался научно-педагогический уровень преподавателей кафедры. Успешно защитили диссертации и получили ученую степень кандидата технических наук: Корпачева Л. Н., Ежеманская С. Н., Джиоева Н. Н., Богданова О. В., Юронен Е. А.
В 2010 году в соответствии с приказом о реорганизации кафедр института управления бизнес-процессами и экономики № 951 от 27.07.2010 года кафедра экономической теории вошла в состав вновь созданной объединенной кафедры экономики и информационных технологий менеджмента под руководством Ступиной Алены Александровны, доктора технических наук, профессора.
В 2020 году кафедра «Экономика и информационные технологии менеджмента решением Ученого Совета Сибирского федерального университета от 02.03.2020 г. была преобразована в кафедру «Цифровые технологии управления».